試管嬰兒胚胎不結合的原因主要包括胚胎質量問題、子宮內膜問題、激素水平問題等。在試管嬰兒過程中，有時可能會出現胚胎與子宮內膜不能完全結合的情況，導致移植失敗。這可能是由于胚胎發育異常、子宮內膜厚度不足或患有子宮內膜異位癥等原因造成的。

胚胎質量問題

有些情況下，雖然成功培育出了多個優質胚胎，但在移植過程中仍可能發現部分胚胎無法成功著床。這可能是由于染色體異常、基因突變或其他遺傳問題導致的。此外經過長時間體外培養的胚胎也可能存在生長停滯或形態異常的情況，影響著床成功率。

子宮內膜問題

子宮內膜是孕育生命的關鍵環節，其厚度和質地對著床至關重要。如果子宮內膜太厚或太薄、缺乏充分血液給予等問題都會影響著床率。此外子宮內膜異位癥、粘連癥等疾病也會影響移植結果。

激素水平問題

體外受精試管嬰兒過程中需要經過一系列激素治療來促進卵泡發育和排卵，并調節子宮內膜準備接受受精卵。如果患者體內雌性激素水平不穩定或波動較大，就容易導致子宮內環境不適合受精卵著床。此外甲狀腺功能異常、黃體功能不全等也會對移植結果產生影響。