免疫系統有問題是比較適合做三代試管嬰兒的，主要還是因為免疫異常通常是由遺傳因素導致的，自然受孕不僅成功率低，即便是成功了也會將其疾病遺傳給下一代，所以一般是建議這類患者做三代試管的。三代試管能夠在胚胎移植前進行染色體和遺傳基因的篩查，進而避免有問題的胚胎移植到女性的宮腔內，以實現優生優育的目的。

對于有免疫性疾病的女性來說，在試管之前是可以進行治療的，一般通過使用免疫制劑調節女性的免疫功能，需在試管移植前進行全面的免疫檢查，然后在試管助孕期間，注入免疫制劑使女性體內產生封閉性抗體，避免免疫系統攻擊或者吞噬胚胎，從而提高試管胚胎移植的成功率，當然具體選擇什么方法進行治療，主要是根據孕婦免疫性不孕的具體原因才能判斷。

免疫性不孕的問題可以通過試管來解決，因為試管嬰兒技術的應用范圍包括免疫性不孕，而且通常情況下，這類人群仍然有正常的精子和排卵功能，排出的精子和卵子是健康的。只要有健康的精子和卵子，男女雙方的身體條件符合試管嬰兒技術的要求，就可以進行試管嬰兒技術的手術治療。